
随着《国家食源性疾病分子溯源网络管理规范》的印发,标志着我国首个基于全基因组序列分型技术的新型食源性疾病分子溯源网络建成,也标志着《食品安全标准与监测评估“十四五”规划》“加快国家食源性疾病分子溯源网络(TraNet)建设,实现食源性致病性微生物全基因组关键分析技术的落地使用,全面提升食源性疾病调查溯源能力”任务的完成。
TraNet是在国家卫生健康委、发改委、财政部、科技部共同支持下建立的基于全基因组序列数据、耐药数据和流行病学信息集成的实验室监测网络,是我国食源性疾病监测技术体系的重要组成部分。网络由国家、省、市三级联动数据中心构成,包括沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌、单核细胞增生李斯特菌、阪崎克罗诺杆菌、金黄色葡萄球菌和弯曲菌等常见食源性致病菌数据库。全基因组测序是一种通过高通量测序技术解析细菌完整基因组序列的方法,能够精确揭示细菌的全部遗传信息。与传统的分子分型技术相比,全基因组测序技术具有更高的分辨率和信息量。这一技术优势使公共卫生专家能够更准确地开展菌株比对分析,有效识别暴发相关菌株,及时追踪食源性疾病暴发事件。通过全基因组测序技术的应用,可显著提升流行病学专家建立食源性疾病与潜在污染食品之间关联的能力,为食品安全监测和暴发调查提供了强有力的技术支撑。网络的建成为我国跨区域(甚至是国际间的)食源性疾病暴发的病因查明和精准溯源提供了有力的技术支撑,对保障公众身体健康、生命安全,保护食品贸易,维护社会稳定都具有重要的战略意义。
网络具有重要毒力因子、耐药基因、血清分子分型等自动化分析模块,满足基层监测技术机构对测序数据的自动分析,助力基层实验室开展微生物致病和耐药机制及遗传进化等方面的应用基础研究。同时,网络可实现原始数据的实时采集、快速上报、安全传输。与国际同类应用技术综合比较,新型食源性疾病分子溯源网络以用户友好的格式为使用人员提供精简的运行管理界面和直观的零代码一键式自动分析应用程序,在数据库类别、分析数据类型、运算速度、分析准确性、数据安全及使用操作性等方面处于国际“并跑”,甚至“领跑”地位。目前网络已覆盖全国32个省级和266家地市级疾病预防控制中心,已在泰国旅行相关肠炎沙门氏菌暴发病例的跨省溯源、冷冻饮品中单核细胞增生李斯特氏菌的跨省追踪,北京肠炎沙门菌跨区暴发溯源调查等多起重大暴发事件调查中发挥作用并得到成功应用示范。
图 1 TraNet网络架构
图 2 TraNet数据库首页
图3 TraNet多重耐药菌网络预警大屏
图4 泰国旅行相关跨省肠炎沙门氏菌暴发
我国首个基于全基因组测序技术的新型食源性疾病分子溯源网络建成-国家食品安全风险评估中心